SARS-CoV-2的变异株-英国

14年2020月2日,英国当局通知世卫组织,通过病毒基因组测序已鉴定出新的SARS-CoV-2变异株。 此变体称为SARS-CoV-202012 VUI 01/2020(“调查变体,12年,第01个月,变体XNUMX”)。 初步分析表明,该变体可以更轻松地在人与人之间传播。 正在进行研究以确定该变体是否与症状严重程度,抗体反应或疫苗功效的任何变化有关。

截至13年2020月1108日,在英国共检测到2例SARS-CoV-202012 VUI 01/2020感染。 在英格兰东南部的COVID-19病例出乎意料的增加之后,于14年41月上旬开始的流行病学和病毒学调查框架中检测到了该变异体。 该事件的特征是在流行病学第50周至第5周(13年2020月5日至10月2日)的4天内,病例通报率增加到三倍以上。 自大流行开始以来,作为常规监测活动的一部分,整个英国平均对所有SARS-CoV-5病毒进行了测序,在英格兰东南部进行了13%的测序。 在50月20日至2020月19日之间,超过60%的来自英格兰东南部的分离株被鉴定为变异株。 一项回顾性分析于XNUMX年XNUMX月XNUMX日在英格兰东南部的肯特郡首次发现了变异体,随后在XNUMX月下旬该变异体迅速扩散。 已发现此变异的大多数COVID-XNUMX病例都对应XNUMX岁以下的人群。

该变体由一组存在14个突变的突变定义,这些突变引起几个氨基酸变化和三个缺失。 其中一些突变会影响病毒在人类中的传播能力:

  • 鉴定出的突变之一(N501Y)正在改变受体结合域(RBD)六个关键残基中的氨基酸。 根据全球禽流感交换倡议(GISAID)数据库,在包括南非在内的多个国家/地区已独立报告了相同的RBD突变(N501Y)(n= 45)和澳大利亚(n= 37)。 序列分析显示,英国报道的病毒N501Y突变和南非报道的病毒分别起源。
  • 在RBD中发现了另一个生物学上重要的突变,即P681H。
  • 最后,已经发现在69/70位的缺失影响一些靶向S基因的PCR诊断测试的效率。 世界各地进行的大多数PCR测试都使用多个目标,因此,预计该变体不会对诊断产生重大影响。

新的VUI-202012 / 01变体已在多个国家/地区被检测到,包括澳大利亚,丹麦,意大利,冰岛和荷兰。

根据英国的初步报告,此变种比以前传播的病毒更易传播,并且估计可传播性提高40-70%(将基本繁殖数R0,4加0,并将其置于1,5至1,7的范围内)。 目前正在进行实验室研究,以确定这些病毒变异株是否具有不同的生物学特性或改变疫苗的功效。 当前,没有足够的信息来确定该变体是否与临床水平上的疾病严重程度,抗体反应或疫苗功效方面的任何变化有关。

公共卫生应对

英国当局正在进行流行病学和病毒学调查,以进一步评估该新变种对传染性,感染严重性,再感染风险和抗体反应的影响。 由于突变之一(N501Y)在受体结合域中,因此当局正紧急调查恢复的和接种的患者血清针对该变异体的中和活性,以确定其是否对病毒疫苗的功效有影响。

英国当局已将有关该变体的基因组数据转移到了GISAID,并在全国范围内对该病毒进行了基因组监视以监视情况。

19年2020月4日,英国当局宣布,受灾地区将受到XNUMX级限制,包括社交聚会的限制,更严格的出行限制,在可能的情况下必须在家工作以及关闭非必要业务的要求。

世卫组织的风险评估

所有病毒都会随时间变化,而SARS-CoV-2也会发生同样的变化,尽管其中大多数突变或变化并不代表该病毒具有直接优势,甚至可能有害于其传播。 需要进行进一步的实验室研究,以更好地理解特定突变对病毒特性以及对诊断,治疗和疫苗功效的影响。 这些调查非常复杂,需要时间和不同研究小组之间的合作。

完整基因组序列的共享有助于合作伙伴进行详细分析。 世卫组织SARS-CoV-2病毒进化工作组正在与其英国同事合作,以更好地了解现有结果并支持进一步研究。

需要尽快进行进一步的流行病学和实验室研究,以了解这些病毒对SARS-CoV-2的临床表现,诊断和治疗以及疫苗开发的后果。

世卫组织的建议

英国的初步发现提出了更广泛的SARS-CoV-2病毒突变问题,WHO强调了与其他国家和研究团队快速共享流行病学,病毒学和完整基因组序列信息的重要性,尤其是通过诸如GISAID的开源平台和别的。

世卫组织建议进行进一步的流行病学和病毒学研究,以了解英国和其他国家描述的具体突变,以便进一步调查该病毒的感染性和致病性方面的任何变化。 世卫组织建议所有国家尽可能增加SARS-CoV-2病毒的常规测序活动,并在国际上共享有关序列的数据,尤其是报告是否观察到了它们。

世卫组织希望提请注意针对该病毒的尖峰(S)基因的PCR试验中功效丧失的问题。 如果说明书中没有明确标识目标基因,建议使用商业PCR试剂盒的实验室与制造商联系以获取更多信息。 另一方面,使用针对病毒S基因的专有PCR测试的实验室应该意识到这一潜在问题。 为了限制对国家检测能力的影响,还建议采用基于针对不同病毒基因的平行或多重PCR检测中不同检测的管理方法,以检测可能出现的变异。 。

所有国家都应评估其当地传播水平,并进行适当的预防和控制活动,包括根据世界卫生组织的指导调整社会和公共卫生措施。

重要的是要提醒社区和医护人员基本原则,以减少传播急性呼吸道感染的总体风险:

  • 避免与患有急性呼吸道感染的人直接接触;
  • 经常洗手,尤其是在与病人或其环境直接接触后;
  • 有急性呼吸道感染症状的人应采取以下预防措施:与他人保持一定距离,打喷嚏或咳嗽时用纸巾或衣服遮住鼻子和嘴巴,并洗手;
  • 对于医疗中心:改善医院(尤其是急诊室)的常规感染预防和控制措施,以及
  • 适当时戴口罩,并确保良好的通风。

世卫组织建议为所有旅行者,包括前往英国或从英国抵达的旅行者,提供上述健康措施。 建议旅行期间或之后旅行并出现急性呼吸道症状的人寻求医疗护理,并向医疗保健专业人员解释他们的旅行经历。 卫生当局应与旅行,运输和旅游部门合作,以便将信息提供给旅行保健中心,旅行社,运输运营商和旅行入境点或即将旅行的人,以减少签约或散布的总体风险急性呼吸道感染。

根据紧急委员会关于COVID-19的紧急会议在最近的会议上提供的建议,世卫组织建议缔约国根据《国际卫生条例(43)》第2005条,定期重新审查其在国际旅行中适用的措施。并继续向世卫组织提供有关严重干扰国际贩运的措施的信息和理由。 各国还应确保影响国际运输的措施以证据和风险评估为基础,并且是一致,相称和有时间限制的。

世卫组织最近发布了关于“在COVID-19范围内对国际旅行采用基于风险评估的方法的注意事项«,这将帮助各国决定如何调整与国际旅行有关的风险限制措施,以期减少SARS-CoV-2的出口,进口和进一步传播,同时避免对国际交通的不必要干扰

世卫组织建议各国采用基于风险评估的方法。 鼓励国家主管部门公布其风险评估方法和适用限制的出口国清单,并定期更新此信息。 无论如何,应优先考虑和便利各国认为重要的旅行(例如,在紧急情况下由工人进行的旅行,公共卫生技术支持的提供者以及运输和安全部门的重要人员的旅行),例如海员;遣返,以及必需品的运输,例如食物,药品和燃料)。

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