SARS-CoV-2の変異株-イギリス

14年2020月2日、英国当局はWHOに、SARS-CoV-2の新しい変異株がウイルスゲノム配列決定によって同定されたことを通知しました。 このバリアントはSARS-CoV-202012VUI 01/2020と呼ばれます(「調査バリアント、12年、01か月、バリアントXNUMX」の場合)。 初期の分析では、バリアントが人々の間でより簡単に広がる可能性があることが示されています。 この変異が症状の重症度、抗体反応、またはワクチン有効性の変化に関連しているかどうかを判断するための研究が進行中です。

13年2020月1108日の時点で、英国では合計2件のSARS-CoV-202012 VUI01 / 2020感染が検出されています。 この変異体は、イングランド南東部でのCOVID-19症例の予想外の増加に続いて、14年41月初旬に開始された疫学的およびウイルス学的調査の一部として検出されました。 このエピソードは、疫学の第50週から第5週までの13日間(2020年5月10日から2月4日まで)に症例通知率が5倍以上に増加したことを特徴としていました。 パンデミックが始まって以来、すべてのSARS-CoV-13ウイルスの平均50〜20%が英国全体で、2020%がイングランド南東部で定期​​的なモニタリング活動の一環としてシーケンスされています。 19月60日からXNUMX月XNUMX日の間に、イングランド南東部からの分離株のXNUMX%以上が変異株として同定されました。 遡及的分析により、XNUMX年XNUMX月XNUMX日にイングランド南東部のケントで最初に特定された亜種が配置され、その後XNUMX月後半に同じ亜種が急速に増殖しました。 この変異が検出されたCOVID-XNUMX症例のほとんどは、XNUMX歳未満の人々に対応しています。

バリアントは、いくつかのアミノ酸の変化と14つの欠失をもたらすXNUMXの突然変異のセットの存在によって定義されます。 これらの突然変異のいくつかは、人間のウイルスの伝染性に影響を与える可能性があります。

  • 同定された変異の501つ(N501Y)は、受容体結合ドメイン(RBD)のXNUMXつの重要な残基のアミノ酸を変更しています。 鳥インフルエンザデータ交換のグローバルイニシアチブ(GISAID)データベースによると、同じRBD変異(NXNUMXY)が、南アフリカを含むいくつかの国で独立して報告されています(n= 45)およびオーストラリア(n= 37)。 配列分析により、英国で報告されたウイルスN501Y変異と、南アフリカで報告されたウイルスNXNUMXY変異は別々に発生したことが明らかになりました。
  • 別の生物学的に重要な突然変異がRBD、P681Hで発見されました。
  • 最後に、69/70の位置での欠失は、S遺伝子を標的とするいくつかのPCR診断テストの効率に影響を与えることがわかっています。 世界中で実施されているほとんどのPCRテストは複数のターゲットを使用しているため、このバリアントが診断に大きな影響を与えることはないと予想されます。

新しいVUI-202012 / 01バリアントは、オーストラリア、デンマーク、イタリア、アイスランド、オランダなど、いくつかの国で検出されています。

英国からの予備報告によると、この亜種は以前に流行していたウイルスよりも伝染性が高く、伝染性が推定40〜70%増加します(基本再生産数R0,4に0を追加し、1,5〜1,7の範囲に配置します)。 ウイルスのこれらの変異株が異なる生物学的特性を持っているかどうか、またはワクチンの有効性を変えるかどうかを決定するための実験室研究が進行中です。 現在、この変異体が臨床レベルでの疾患の重症度、抗体反応、またはワクチンの有効性の変化に関連しているかどうかを判断するのに十分な情報はありません。

公衆衛生上の対応

英国当局は、この新しい亜種が伝染性、感染の重症度、再感染のリスク、および抗体反応にもたらす変化をさらに評価するために、疫学的およびウイルス学的調査を実施しています。 変異の501つ(NXNUMXY)は受容体結合ドメインにあるため、当局は、この変異体に対する回復およびワクチン接種を受けた患者の血清の中和活性を緊急に調査して、ウイルスワクチンの有効性に影響があるかどうかを判断しています。

英国当局は、この亜種のゲノムデータをGISAIDに転送し、状況を監視するために全国のウイルスのゲノム監視を維持しています。

19年2020月4日、英国当局は、影響を受ける地域が、懇親会の制限、移動のより厳しい制限、可能な限り在宅勤務の要件、および重要でない事業の閉鎖を含むレベルXNUMXの制限の対象となることを発表しました。

WHOによるリスク評価

すべてのウイルスは時間の経過とともに変化し、SARS-CoV-2も変化しますが、これらの変異や変化のほとんどはウイルスに直接利益をもたらすものではなく、ウイルスの蔓延に悪影響を与える可能性さえあります。 ウイルスの特性および診断、治療、ワクチンの有効性に対する特定の突然変異の影響をよりよく理解するには、さらなる実験室研究が必要です。 これらの調査は複雑であり、異なる研究グループ間の時間と協力が必要です。

完全なゲノム配列の交換により、パートナーによる詳細な分析が容易になります。 SARS-CoV-2ウイルスの進化に関するWHOワーキンググループは、英国の同僚と協力して、入手可能な結果を​​よりよく理解し、さらなる研究を支援しています。

SARS-CoV-2の臨床症状、診断、治療、およびワクチンの開発におけるこれらのウイルスの影響を理解するには、さらなる疫学および実験室での研究が可能な限り迅速に必要です。

WHOの推奨事項

英国の予備調査結果は、SARS-CoV-2ウイルス変異のより広範な問題を提起し、WHOは、特にGISAIDやなどのオープンソースプラットフォームを通じて、疫学的、ウイルス学的、および完全なゲノム配列情報を他の国や研究チームと迅速に共有することの重要性を強調しています。その他。

WHOは、ウイルスの感染性と病原性の変化をさらに調査するために、英国およびその他の国によって記述された特定の突然変異を理解するために、さらなる疫学およびウイルス学的研究を推奨しています。 WHOは、SARS-CoV-2ウイルスのルーチンのシーケンス活動を可能な限り増やし、シーケンスデータを国際的に共有し、特にそれらが観察されたかどうかを報告するようにすべての国にアドバイスしています。

WHOは、ウイルスのスパイク(S)遺伝子を標的とするPCR検査の有効性が失われるという問題に注意を向けたいと考えています。 市販のPCRキットを使用している研究所は、指示で標的遺伝子が明確に特定されていない場合、詳細について製造元に問い合わせることをお勧めします。 一方、ウイルスS遺伝子を標的とする独自のPCRテストを使用している検査室は、この潜在的な問題に注意する必要があります。 国の検出能力への影響を制限するために、異なるウイルス遺伝子を標的とする並行または多重PCR試験の異なる試験の実施に基づくアプローチを採用して、発生する可能性のある変異体を検出することも推奨されます。 。

すべての国は、地域の感染レベルを評価し、WHOのガイダンスに従って、社会的および公衆衛生対策の適応を含む、適切な予防および管理活動を実施する必要があります。

急性呼吸器感染症の感染の全体的なリスクを減らすための基本原則を地域社会と医療従事者に思い出させることが重要です。

  • 急性呼吸器感染症に苦しむ人々との直接の接触を避けてください。
  • 特に病気の人やその環境に直接触れた後は、頻繁に手を洗ってください。
  • 急性呼吸器感染症の症状のある人は、次の予防措置を講じる必要があります。他の人から距離を置き、くしゃみや咳をするときは、鼻や口をティッシュや衣服で覆い、手を洗います。
  • ヘルスケアセンターの場合:病院、特に救急ユニットでの日常的な感染予防と管理の実践を改善し、
  • 必要に応じてマスクを着用し、十分な換気を確保してください。

WHOは、英国に向かう旅行者または英国から到着する旅行者を含むすべての旅行者に、上記の健康対策を推奨しています。 旅行中または旅行後に急性呼吸器症状を発症する人は、医師の診察を受け、医療専門家に行った旅について説明することをお勧めします。 保健当局は、旅行、運輸、観光の各セクターと協力して、旅行保健センター、旅行代理店、運輸業者、入国地の個人に情報が提供されるようにする必要があります。急性呼吸器感染症。

直近の会議でCOVID-19に関する緊急委員会によって提供されたアドバイスに沿って、WHOは、締約国がIHRの第43条に従って、海外旅行の文脈で適用する措置を定期的に再検討することを推奨します。 )そして、国際交通を著しく妨害する措置に関する情報と正当化をWHOに提供し続ける。 各国はまた、国際交通に影響を与える措置が証拠とリスク評価に基づいており、一貫性があり、釣り合いが取れており、期限が定められていることを確認する必要があります。

WHOは最近、 'に関する暫定ガイドを公開しました。COVID-19の文脈での海外旅行へのリスク評価ベースのアプローチの適用に関する考慮事項«、これは、国際交通への不必要な干渉を回避しながら、SARS-CoV-2の輸出、輸入、およびさらなる感染を減らす目的で、各国が海外旅行に関連するリスク制限措置を調整する方法を決定するのに役立ちます

WHOは、各国がリスク評価に基づくアプローチを適用することを推奨しています。 各国当局は、リスク評価の方法論と制限が適用される出口国のリストを公開し、この情報を定期的に更新することをお勧めします。 いずれにせよ、各国が不可欠と考える旅行は、常に優先順位を付けて促進する必要があります(緊急対応の労働者、公衆衛生の技術サポートの提供者、および船員などの輸送およびセキュリティ部門の重要な要員による旅行、帰国など)。 、および食料、医薬品、燃料などの必需品の輸送)。

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